למד רפואה בביה״ס לרפואה של אוניברסיטת נורת׳ווסטרן והתמחה ברפואת ילדים בבית החולים ג׳ונס הופקינס. הוא שימש פרופסור לאימונולוגיה; מנהל בתכנית שיתוף הפעולה של חיסון תאי T ; מנהל מרכז קוך־מינרבה לחקר מחלות אוטואימוניות; מנהל המכון הלאומי לביוטכנולוגיה בנגב, ועוד.
כהן הוא חתן פרס רוברט קוך, פרס מייסדי טבע, פרס AESKU ופרס UFIS, בין היתר, וזכה גם בפרס דוקטור לשם כבוד מטעם אוניברסיטת המבורג. הוא חוקר מצוטט ביותר (על פי ISI Web of Science, למעלה מ-25,000 ציטוטים;79 במדד הירש), ולו למעלה מ־545 פרסומים, לרבות הספרים
Tending Adam’s Garden: Evolving the Cognitive Immune Self. Academic Press. 2000, and Rain and Resurrection. Ilow the Talmud and Science Read the World. Landes